【lammps】lammpsをMPI環境(並列して)で使う！！ - どぼるざーくとゆく、高分子シミュレーション

皆さんこんばんは！

前回の記事でlammpsの導入をしましたが、単コアの環境しか出来ていなかったので並列化計算ができるようにしました！！

(lammpsのメリットは並列化ですもんね(^^♪)

それではやりましょう。

まずは前回記事と同様にlammpsをダウンロードして、必要なパッケージを選択します。(OPTパッケージが並列化にはおススメだそうです。)

⇓過去の記事

sudo apt install build-essential libopenmpi-dev

のコマンドを使うとOpenMPIがインストールされます。他にもMake,C++のコンパイラが必要になるそうなので、適宜導入しましょう。

make mpi

をsrcファイルで実行する。これでlmp_mpiファイルが作成される。

そのファイルが実行できていないのでLinux パーミッションを変更します。

chmod 777　(フォルダのディレクトリ)　　　(例　chmod 777 lammps/src/tuyo.file)

詳しくは以下のページを参考にしました。

いかがでしたか？

makeが実行できないエラーは主にパーミッションによる部分なので、そこに注意をしてMPI環境を構築しましょう！！